一、所有包裝食品及散裝食品、直接供應飲食場所就公告品項，使用基因改造食品原料，卻沒有標示，一經查獲，將可依食品安全衛生管理法第47條第1項第8款或第10款規定，可處新臺幣3萬元以上300萬元以下罰鍰；情節重大者，並得命其歇業、停業一定期間、廢止其公司、商業、工廠之全部或部分登記事項，或食品業者之登錄；經廢止登錄者，一年內不得再申請重新登錄。
二、違規產品依據食安法第 52 條第 1項第 3 款規定，該產品應通知限期回收改正，改正前不得繼續販賣；屆期未遵行將沒入銷毀之。